La MSH de Dijon s’inscrit dans le dispositif de recherche à l’échelle de l’EPE Bourgogne Europe et du CNRS de plusieurs manières.

Elle est une structure de recherche interdisciplinaire commune à tous les laboratoires et équipes en SHS du grand campus dijonnais. Elle possède également des priorités scientifiques qui définissent des axes en fonction desquels elle soutient la recherche interdisciplinaire. La MSH de Dijon est structurée actuellement dans le cadre de trois axes (auxquels il faut ajouter un axe commun avec la MSHE de Besançon) et elle offre aux laboratoires et à leurs équipes la possibilité d’organiser des rencontres et des coopérations dans le cadre de programmes de recherches.

La structuration scientifique de la MSH de Dijon s’exprime aussi grâce à des groupes thématiques de recherche. Elle s’appuie également sur une offre technologique fondée sur des compétences d’ingénierie et une instrumentation de haut niveau mutualisées au service des opérations de recherche en Sciences Humaines et Sociales.

La MSH de Dijon développe, accompagne et soutien des projets interdisciplinaires innovants en lien avec des acteurs du milieu socio-économique.