Forum d’imagerie scientifique : quand les cellules rencontrent l’espace

Evènement organisé par le Comité d’orientation stratégique des plateformes et la plateforme GéoBFC de la Maison des Sciences de l’Homme :  Conférences, ateliers, tables rondes, stands et démonstrations.
Avec le soutien de la Maison des Sciences de l’Homme de Dijon, l’Université de Bourgogne et les établissements du Grand Campus de Dijon : AgroSup, CEA, CGFL, CHU, CNRS, ENSAM, ESC, INRA, INSERM

Quand? : 13 février 2017, de 9h à 18h
Où? : Maison des Sciences de l’Homme de Dijon

[INSCRIPTION EN LIGNE AUX TABLES RONDES/ATELIERS]

Programme :

9h : Accueil

9h15 : Introduction / Alain Bonnin, président de l’Université de Bourgogne –  Francis Aubert, Directeur Maison des Sciences de l’Homme de Dijon

9h30 : Conférence : vision Artificielle Bio-Inspirée / Michel Paindavoine (ESIREM & UMR 5022 LEAD, CNRS, uB)

10h30 : Offre du centre de calcul et data center, exemples d’applications utilisant les ressources / Didier Rebeix (Centre de calcul, Université de Bourgogne)
OU
10h30 : Atelier : préparer des missions d’acquisition d’images et de données par aéronefs sans humain à bord (drones et aéronefs captifs), cadre réglementaire et démarche opérationnelle / Laure Saligny (USR 3516 MSH Dijon, CNRS, uB), Philippe Gasnot (Dirsu CNRS)

12h : buffet

13h30 : Table ronde : les différents types de microscopie, passage de l’une à l’autre / Jean-Marie Perrier-Cornet (PAM, AgroSup, uB) – Pascale Winckler (PAM, AgroSup, ub)
OU
13h30 : Table ronde : Imagerie 3D / Rémi Laffont (UMR5561 Biogéosciences, CNRS-uB), Nicolas Navarro (UMR 5561 Biogéosciences, CNRS-uB)
OU
13h30 : Table ronde : quelles échelles pertinentes pour quelles applications ? /  Amélie Quiquerez (UMR 6298 ARTEHIS, CNRS-uB), Nadège Martiny (UMR Biogéosciences)

15h : Conférence : de l’imagerie pour l’étude des paysages dans la longue durée / Laure Nuninger (UMR 6249 Chrono-Environnement, USR 3124 MSHE N.Ledoux, CNRS – UFC)

16h : Intelligence embarquée au service de l’imagerie / Dominique Ginhac (UMR 6306 LE2I, CNRS, Arts et Métiers, uB, AgroSup)

16h30 : Présentation du numéro en ligne sur l’imagerie scientifique de la Recherche – Nicolas Popovic (Responsable communication digitale, université de Bourgogne)  /  Restitution de l’enquête “Imagerie”– Laure Saligny USR 3516 MSH Dijon, CNRS, uB et COS uB)-/ Table ronde et restitution de la journée – Francois Brunotte (professeur hospitalier, CGFL, UMR 6306 LE2I, responsable IMAPPI), Franck Denat (directeur UMR 5260 ICMUB) Dominique Ginhac (directeur UMR 6306 LE2I),  Pascal Neige (Vice-Président délégué à la recherche de l’université de Bourgogne), JeanMarie Perrier-Cornet (responsable plateforme DIMACELL)

Différents stands seront animés en parallèle et en continu tout au long de la journée :

ARCEN : Centre mutualisé Micro/Nano Caractérisations
Le Centre de Micro/Nano Caractérisation est une entité du Département Technique d’Analyses et Instrumentation (DTAI) du Laboratoire Interdisciplinaire Carnot de Bourgogne (ICB).
Tous les équipements du CMNC sont également intégrés à la Plateforme ARCEN Carnot qui est une structure dédiée à la gestion d’équipements lourds et/ou mi-lourds dans le domaine de la caractérisation et de la fabrication, mis en commun au service des usagers.
Le CMNC apporte ainsi un soutien technique à la communauté scientifique et aux industriels, en mettant à leur disposition des équipements performants. Les instruments gérés par le CMNC sont répartis en 5 services: Caractérisation des Matériaux Densifiés et Divisés, Diffraction des Rayons-X (DRX), Microscopie Electronique à Balayage (MEB), Microscopie Electronique en Transmission (MET) et   Analyse des Surfaces et Interfaces (XPS/AES)
Lien : https://icb.u-bourgogne.fr/fr/services-communs/plateformes-techniques.html

DImaCell : imagerie cellulaire fonctionnelle appliquée à la biologie
La Plateforme DImaCell (Dispositif d’Imagerie Cellulaire Bourgogne Franche-Comté) est spécialisée en imagerie cellulaire fonctionnelle appliquée à la biologie. Elle rassemble des technologies assurant un continuum d’échelle et accessibles à l’ensemble de la communauté scientifique (Universités, EPST et entreprises privées).
Cette plateforme possède un parc d’équipements complémentaires permettant de mettre en place un pôle de microscopies électronique et biophotonique dans les sciences du vivant. Elle crée une expertise régionale en technologies et méthodologies liées à l’imagerie cellulaire et moléculaire dynamique et à l’étude d’interactions moléculaires en temps réel.   
Le stand présentera les différents équipements et techniques disponibles sur la plateforme DImacell, ainsi que des exemples de réalisation et de traitement d’image.
Lien : www.dimacell.fr

GeoBFC : imagerie LIDAR et drones (MSH Dijon et MSHE Besançon)
Les rôles de la PFT : soutenir les équipes de recherche et les doctorants en Sciences Humaines et Sociales (SHS) du Pôle de Recherche et d’Enseignement Supérieur (PRES) Bourgogne- Franche-Comté, et les partenaires institutionnels des deux MSH dans le développement et la conduite des programmes de recherche pluridisciplinaires intégrant une composante géographique ; mutualiser les outils et les compétences spécialisées au service des spécialistes ou non-spécialistes scientifiques ; partager les compétences techniques indispensables et proposer des formations conjointes ; organiser et assurer la veille technologique et l’expérimentation.
Les domaines de compétences sont : les acquisitions cartographiques et topographiques, la constitution de bases de données géographiques, le traitement et l’analyse spatiale de données, la télédétection (imagerie et Lidar), la modélisation, la conception et la gestion de systèmes d’information géographique, la création d’applications de cartographies en ligne, le développement de logiciels et la visualisation cartographique.
Présentation et démonstration de l’offre de service dans le domaine de l’imagerie spatiale et de la virtualisation (posters, demo sur ordinateurs) notamment dans les technologies suivantes prises de vue et missions par aéronefs captifs, photogrammétrie, suivi d’acquisitions LiDAR aéroporté, traitements de données LiDAR, télédétection imagerie haute résolution, diffusion de l’imagerie et virtualisation.
Liens : http://geobfc.hypotheses.orghttp://msh-dijon.u-bourgogne.fr/plateforme-technologique-geomatique-bfc.html
http://mshe.univ-fcomte.fr/plate-forme-technologique/pft-geobfc
https://twitter.com/geobfc

Microondes : imagerie pour l’électronique et interaction nanomatériaux (interface – ICB UMR 6303)
La présences des différents matériaux (nanomatériaux entre autre)  au sein des composants et circuits électroniques est un nouvel enjeu dans les nombreux domaines que couvre l’électronique (transport, défense, communication notamment).
L’équipe GERM (dept Interface de l’ICB URM 6303) a depuis 2000 une expertise reconnu  (dont deux brevets et une start-up) dans les domaines de l’interaction microondes matériau  tant d’un point de vue chauffage (élaboration de nanomatériaux), détection de polluants  et depuis 2005 en microscopie microondes.
L’équipe CEM (dept Photon, IP UMR 6602) est reconnue dans les domaines de la compatibilité électromagnétique (expérimentale  et théorique) et de la simulation électromagnétique.Membres de l’IEEE SENSOR, Instrumentation et EMC, le groupe formé par les deux équipes vise  à proposer des solutions originales  dont  un imageur microondes et radiofréquences pour répondre aux besoins de CEM ( cartographie dechamps) ou interaction (nano)matériau ondes électromagnétique : résolution micrométrique, étendue de mesure jusqu’à quelques décimètres et comparaison nos outils de caractérisations classiques des matériaux ou pour la CEM
Lien : http://icb.u-bourgogne.fr/fr/axes-scientifiques/interfaces/microondes.html

Le2i avec les plateformes de Recherche et Innovation en Immersion Virtuelle (PeTRiiV) et Vision 2D/2D+/3D : systèmes d’images, Architecture des Systèmes Electroniques de vision, immersion virtuelle, système d’imagerie non-conventionnelle, traitement des images

MorphOptics : pétrologie sédimentaire, la biominéralisation, la morphométrie 2D et 3D et l’écologie du comportement (laboratoire Biogéosciences)
Le service MorphOptics du laboratoire Biogéosciences met à disposition des chercheurs, un ensemble d’outils dédiés à l’imagerie dans les domaines de compétence de l’unité. Ces domaines couvrent la pétrologie sédimentaire, la biominéralisation, la morphométrie 2D et 3D et l’écologie du comportement. Les principaux équipements comprennent :
– un parc d’appareils de microscopie optique (loupes, microscopes et macroscopes équipés de filtres polarisants ou de modules de cathodoluminescence et d’épifluorescence ) et de caméras numériques dédiés à l’observation d’échantillon de roches (analyses sédimentologiques, diagénétiques) ;
– un MEB de paillasse utilisé pour l’observation fine des structures minéralisées d’organismes avec possibilité de marquages moléculaires des échantillons (immunogold) ;
– une gamme d’appareils de numérisation 3D (µCT scan à RX, scanner surfacique à lumière structurée, Microscribe) et de stations de travail (logiciels d’analyse d’image 3D), de calcul et de stockage des données pour des analyses de morphométrie ;
– un parc d’appareils de microscopie optique (loupes et microscopes, avec module de fluorescence) équipés de caméras numériques pour l’observation et des analyses biométriques dans des applications de parasitologie.

Plateforme WOMAM, LaBoMaP ENSAM Cluny
Le LaBoMaP est un laboratoire de 40 personnes réparties en trois équipes de recherche (Usinage Grande Vitesse (UGV), Ingénierie Matériaux et Surfaces (IMS), Matériau et Usinage Bois (MUB)).
Une structure de valorisation AMVALOR est adossée à ce laboratoire pour assurer le transfert technologique avec le tissu industriel.
Thématiques de recherche dans le domaine de la coupe des métaux, des matériaux composites et du bois ainsi que la transformation et la caractérisation des surfaces.
Nos domaines d’application sont dirigés vers les secteurs du transport (automobile, aéronautique, ferroviaire), du nucléaire, de la filière bois…
Pendant le forum, démonstrations et présentations sous forme de 3 ateliers :
РEtude de la coupe par imagerie ultra-rapide avec cam̩ra Photron SAZ / (d̩monstration)
– Analyse 3D d’une géométrie d’outil complexe par imagerie confocale avec microscope Alicona / (démonstration)
– Imagerie au service de la caractérisation (microscopie optique, MEB FEG, EDX, WDX, µdureté) / (présentation)
Lien : www.labomap.ensam.eu

Plateforme d’imagerie préclinique : chimie, image, thérapie
La plateforme d’imagerie préclinique est localisée au centre de lutte contre le cancer Georges-François Leclerc. Elle est implantée au sein du service de médecine nucléaire (chef de service : Pr Alexandre Cochet, CGFL-CHU-Le2i) dont elle est unité fonctionnelle. Elle est sous la responsabilité scientifique et opérationnelle du Pr François Brunotte (CGFL-CHU-Le2i) et du Dr Bertrand Collin (CGFL-ICMUB). La plateforme comporte comme personnels permanents : un chef de projet (Dr Alexandra Oudot, CGFL), deux ingénieur de recherche (Dr Pierre-Simon Bellaye et M. Alan Courteau, CGFL) et 2 techniciennes de laboratoire (Mélanie Guillemin et Camille Drouet, CGFL). 
Compte-tenu de ses spécificités et de sa localisation, la plateforme accueille des personnels du service de médecine nucléaire pour de l’expertise en radiophysique et du suivi de la radioprotection. Les thématiques de la plateforme sont l’imagerie moléculaire et la thérapie des cancers (radiothérapie, thérapies ciblées) ainsi que les pathologies cardiovasculaires. Au vu de ses compétences et de la transversalité de l’imagerie, les domaines d’application touchent principalement le développement de nouvelles molécules à visée diagnostique et/ou thérapeutiques (théranostique) principalement dans le domaine du cancer et des pathologies cardiovasculaires (insuffisance cardiaque et athérosclérose). Ceci se fait dans un environnement partenarial fort tant au niveau académique à travers notamment les appartenances de ses responsables (e.g : ICMUB, Le2i, ICB, UTINAM, INSERM U866…) qu’industriel (MRS solutions, Debiopharm, Roche…) et permet de travailler de la chimie à l’image et à la thérapie. La plateforme d’imagerie préclinique dispose de tout l’environnement et toutes les ressources nécessaires pour mener à la fois des missions de R&D internes ou pour des partenaires privés / académiques.
Elle bénéficie également de la présence en son sein d’un Equipex (IMAPPI) visant à développer un nouvel imageur PET/IRM au potentiel clinique très important. Enfin, la plateforme bénéficie également du rayonnement occasionné par le GIE Pharmimage et le GIS de Pharmacoimagerie, véritables générateurs d’opportunités tant sur le plan de la recherche que des prestations.